肠胃不好且有口臭时，需依据病因来选取相应的治疗方式。具体如下：
一、消化不良。胃肠动力欠佳会致使食物在胃内堆积时间过久，经异常发酵后产生异味气体，进而导致口臭现象。这种情况下可在医生指导下服用奥美拉唑、雷贝拉唑等药物进行医治，它们能够加快食物的消化与吸收，从而可改善口臭情况。
二、幽门螺杆菌感染。幽门螺杆菌在口腔中会分解尿素，从而引起口臭现象，此时需要遵循医嘱服用奥美拉唑、枸橼酸铋钾、阿莫西林、克林霉素等药物予以治疗。
三、肠道菌群紊乱。肠道菌群紊乱同样可能引发口臭现象，可以遵医嘱服用乳酸菌素片、布拉氏酵母菌散等药物来调节肠道内的菌群，对脾胃功能进行调理。肠胃不好引发口臭的患者，建议前往医院完善检查，明确病因后给予具有针对性的治疗。除了进行治疗外，日常还需做好口腔卫生，饭后使用淡盐水或清水漱口，也能对口臭问题起到改善作用。
总之，对于肠胃不好有口臭的情况，要明确具体原因并采取合适的治疗措施，同时注意口腔卫生维护。