急性肾盂肾炎的治疗主要包括抗感染治疗、对症支持治疗等。一般来说，通过及时有效的治疗，大多患者可在1~2周内病情得到控制。
抗感染治疗
选用敏感抗生素： 医生通常会根据尿液细菌培养和药敏试验结果选择敏感的抗生素。常见的有喹诺酮类药物，如氧氟沙星等，这类药物能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用；还有头孢菌素类，像头孢呋辛，可抑制细菌细胞壁的合成来达到杀菌目的。根据病情严重程度给药： 如果是轻型急性肾盂肾炎，可口服抗生素治疗，一般疗程为10~14天；若病情较重，出现高热等全身症状，多需静脉输注抗生素，待病情好转、体温正常后，可改为口服抗生素继续完成整个疗程。
对症支持治疗
缓解发热等症状： 对于发热的患者，体温超过38.5℃时，可使用退热药物，如对乙酰氨基酚，它能通过抑制前列腺素合成来发挥退热作用。多饮水多排尿： 患者要保证每日饮水量在2000毫升以上，通过增加排尿量来冲洗尿道，促进细菌及炎症物质的排出，有助于病情恢复。
纠正易感因素
治疗泌尿系统基础疾病： 如果患者本身有泌尿系统结石、梗阻等基础疾病，需要积极治疗。比如有泌尿系统结石的患者，较小的结石可通过多饮水、适当运动促进排出，较大的结石可能需要进行体外冲击波碎石或手术取石等治疗，解除梗阻后有利于急性肾盂肾炎的康复并防止复发。注意个人卫生： 女性患者要特别注意会阴部清洁，性生活后应及时排尿，以减少细菌感染尿道上行至肾盂的机会。