屁股上长痘痘很痛，可能是毛囊炎、传染性软疣、结节性红斑。具体如下：
一、毛囊炎：主要是由痤疮丙酸杆菌感染导致，常发生在内分泌失调的青壮年人群中。其发病原因是毛囊、皮脂腺导管堵塞，使得内容物无法正常代谢，进而引发周围相关炎症反应，从而引起疼痛。在治疗上，外用药物可选择鱼石脂软膏、红霉素软膏、夫西地酸乳膏等进行外涂。必要时还可口服抗生素来进行抗感染治疗，比如常用的有头孢类抗生素等。
二、传染性软疣：是由传染性软疣病毒感染引起，会有一定瘙痒感，若患者过度搔抓后，局部可能出现相应炎症反应，就会导致疼痛。常见的治疗方法主要有，(1)用镊子将软疣小体完全去除，然后涂以碘酊并压迫止血；(2)用刮勺清除创面后，再用电灼烧使创面干燥；(3)也有单位采用冷冻的方式来治疗。
三、结节性红斑：一般是由细菌、病毒等微生物感染以及免疫功能紊乱引发脂膜炎而导致疼痛。对于结节性红斑的治疗，首先要积极寻找病因，并针对病因及局部进行对症治疗。其次，在药物治疗和全身治疗方面，如果疼痛较为明显，可以口服止痛药和非甾体消炎药，例如布洛芬、芬必得、扶他林等。
以上用药都需要在医生指导下使用，切不可自行用药。总之，当屁股上长痘痘且很痛时，应及时就医，明确具体病因后，采取针对性的治疗措施。