萎缩性胆囊结石可通过药物治疗、手术治疗、一般治疗等方式予以医治。
一、药物治疗：
1.若萎缩性胆囊炎合并胆结石的情况不算严重，可采用药物方式治疗，首选药物包含多种，例如金甲排石胶囊、大黄利胆胶囊、消炎利胆片等。其中金甲排石胶囊属于中成药，主要成分有桃仁、车前子、广金钱草、没药等，能够起到活血化瘀、利尿通淋排石的作用；大黄利胆胶囊的主要作用是清热利湿解毒，可缓解萎缩性胆囊炎引发的腹部疼痛等不良反应。
二、手术治疗：
1.超一半的患者出现萎缩性胆囊炎是由胆结石导致，如果患者经药物治疗没有效果，可采取手术方式进行治疗。手术包括传统手术和微创手术，传统手术主要是将胆囊切除，如此能彻底根除病灶，复发率较低；微创手术是在腹部切开小于三公分的切口，该方案不但操作简便，而且恢复速度快。
三、一般治疗：
1.患者在治疗期间于饮食方面需加以注意，应遵循清淡高营养、高维生素、低脂肪的原则，一日三餐要定时定量，待病情稳定后，可多参与体育锻炼，以提升自身免疫功能。
萎缩性胆囊结石确诊后，应尽早进行医治，并遵循医嘱用药。