引起睡觉头疼疼醒很厉害的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.睡眠呼吸暂停综合征：这是一种在睡眠中反复发生呼吸暂停或低通气的疾病，会导致间歇性缺氧和睡眠中断，从而引起头疼。
2.偏头痛：偏头痛是一种常见的原发性头痛，其特征是反复发作的单侧或双侧搏动性头痛，常伴有恶心、呕吐、光和声过敏等症状。偏头痛可能在睡眠中发作，导致头疼疼醒。
3.紧张型头痛：这是一种最常见的原发性头痛，通常与头颈部肌肉紧张有关。紧张型头痛可能在睡眠中加重，导致头疼疼醒。
4.药物副作用：某些药物，如抗抑郁药、降压药、镇痛药等，可能会引起头疼。如果在睡眠前服用这些药物，可能会导致头疼疼醒。
5.其他原因：如颈椎病、颅内感染、颅内占位性病变、代谢性疾病、心理因素等也可能导致睡觉头疼疼醒很厉害。
需要注意的是，头疼疼醒很厉害可能是严重疾病的信号，如蛛网膜下腔出血、脑炎、脑膜炎等。如果头疼频繁发作或伴有其他症状，如恶心、呕吐、意识不清、肢体无力等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因并进行针对性治疗。