大肠水疗是指利用专用干净水通过机器或人工辅助对大肠进行清洗以实现清洁肠道目的的一种手段。一般应用于习惯性便秘、慢性结肠炎、肠梗阻等患者的辅助治疗，既有好处也有坏处。
一、好处：
1.能协助人体排出粪便和大肠内的有害物质，有效解决排便不畅问题，改善便秘、腹胀情况。
2.在特殊疾病如自闭症中，大肠水疗可改善局部肠道环境。
二、坏处：
1.频繁进行大肠水疗可能造成肠道菌群紊乱，引发肠道菌群失调，因为肠道菌群主要寄生在粪便里，人体肠道至少保有50克的粪便才能保证肠道寄生菌的生存，经液体冲洗破坏平衡后会导致人体免疫功能下降。
2.虽仅用水而未使用化学药剂，但也会导致肠道黏膜表层黏液大量流失，扰乱肠道环境，甚至加重便秘。所以大肠水疗只能作为便秘患者的辅助治疗，不建议频繁使用。
此外，如果存在严重心脏病、肠道肿瘤、严重贫血、疝气、肛瘘管、严重痔疮、肾功能低下等疾病，应禁止使用大肠水疗。而在进行大肠水疗后，要注意少量多餐，食用柔软且容易消化的食物，如馒头、米粥等，避免辛辣、刺激食物，如辣椒、火锅等，以免给大肠带来不必要的负担。
总结概况提示：大肠水疗能清洁肠道，对一些疾病有辅助治疗作用，但频繁使用有弊端，且有特定疾病者禁用，水疗后饮食也需注意。