百令胶囊主要用于肺肾两虚引起的咳嗽、气喘等。它的主要禁忌如下：
过敏人群禁忌
对百令胶囊成分过敏者： 百令胶囊的主要成分是发酵冬虫夏草菌粉，若本身对其中任何成分过敏，服用后可能会引发过敏反应，如皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等症状。所以，明确对该成分过敏的人群禁止使用。
特殊人群禁忌
孕妇： 目前虽然关于百令胶囊对孕妇及胎儿影响的临床研究相对有限，但从安全角度考虑，孕妇属于特殊人群，为避免可能对胎儿产生的未知影响，一般不建议孕妇使用百令胶囊，如需使用应在医生的严格评估下谨慎决定。儿童： 儿童身体各器官发育尚不完善，对药物的代谢和耐受能力与成人不同，百令胶囊用于儿童的安全性和有效性尚未完全明确，所以儿童使用百令胶囊需格外谨慎，一般不推荐儿童自行服用，必须使用时应在医生指导下，根据儿童的具体情况（如体重、病情等）权衡利弊后再决定是否使用。
疾病相关禁忌
感冒发热患者： 当人体处于感冒发热状态时，机体处于应激状态，此时服用百令胶囊可能会影响病情的恢复，或者与感冒发热时使用的其他药物发生相互作用。所以感冒发热患者不宜服用百令胶囊，应等感冒发热症状缓解后再考虑是否使用。有严重基础疾病者： 如患有严重心脑血管疾病、肝肾功能不全等严重基础疾病的患者，由于其自身机体功能存在一定程度的异常，服用百令胶囊后药物的代谢、排泄等过程可能会受到影响，进而可能加重基础疾病或引发其他不良反应。这类患者使用百令胶囊需在医生的密切监测下进行。