半月板囊肿的治疗方法需根据具体情况选择，一般来说，较小的无症状半月板囊肿可先观察，而有症状的半月板囊肿常需手术等干预。手术治疗是较为常用的方法，如关节镜下半月板囊肿切除术，约80%以上的患者通过手术可改善症状。
手术治疗方式
关节镜微创手术： 这是治疗半月板囊肿常用的手术方式。通过关节镜可以清晰地看到半月板囊肿的位置，然后将囊肿切除。手术创伤相对较小，术后恢复较快，一般住院时间在3 - 7天左右。开放手术： 对于一些复杂的半月板囊肿，可能会采用开放手术。但开放手术创伤较大，恢复时间相对较长，目前应用不如关节镜微创手术普遍。
非手术治疗情况
观察随访： 如果半月板囊肿较小，且患者没有任何症状，医生可能会建议观察随访。一般每隔3 - 6个月进行膝关节的超声或磁共振检查，观察囊肿是否有变化。例如，对于一些老年人，身体状况较差，无法耐受手术时，可先选择观察。物理治疗： 物理治疗可以缓解半月板囊肿引起的一些症状，如疼痛等。常见的物理治疗方法有热敷，每天可热敷膝关节2 - 3次，每次15 - 20分钟，温度不宜过高，避免烫伤皮肤；还有超短波治疗，能促进局部血液循环，减轻炎症反应，但物理治疗一般不能使囊肿消失，多作为辅助治疗手段。
术后康复注意事项
早期康复： 术后1 - 2周内，患者要注意休息，可进行膝关节的屈伸练习，但幅度不宜过大。例如，在卧床时进行直腿抬高练习，每次抬高到30度左右，保持5 - 10秒，然后放下，每天练习3 - 4组，每组10 - 15次。中期康复： 术后2 - 6周，可逐渐增加膝关节的活动度。可以在医生或康复治疗师的指导下进行膝关节的屈伸训练，在无痛范围内逐渐增大活动范围。同时，可开始进行部分负重行走，如使用拐杖辅助下的部分负重，根据恢复情况逐渐增加负重的比例。后期康复： 术后6周以后，可逐渐恢复正常的行走和一些轻度的运动，但要避免剧烈运动和长时间的蹲起等动作。一般在3 - 6个月后可基本恢复正常的日常生活活动，但完全恢复运动可能需要3 - 6个月甚至更长时间。