治疗霉菌性阴炎常用的药物有局部用药和全身用药。一般来说，局部使用抗真菌药物治疗较为常见，多数患者通过规范用药能取得较好效果。
局部用药为主
克霉唑制剂：常见的有克霉唑栓，每晚1粒（150mg），连用7日；或每日早、晚各1粒（150mg），连用3日。克霉唑能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。硝酸咪康唑制剂：像硝酸咪康唑栓，每晚1粒（200mg），连用7日；也可采用3日疗法，每日早、晚各1粒（200mg），或者单粒400mg，一日1次，连用3日。它通过影响真菌细胞膜的通透性来起到抗真菌功效。
全身用药情况
氟康唑：对于不能耐受局部用药、未婚女性及不适合局部用药者可选用。氟康唑一次口服150mg即可，但需要注意，有一些人群使用时要谨慎，比如肝功能不全者等，使用前需咨询医生。不过全身用药相对局部用药来说，不是首选，因为局部用药直接作用于病变部位，全身副作用相对小一些。
特殊人群需注意
孕妇：孕妇患霉菌性阴炎多以局部用药为主，尽量不要使用全身用药。因为全身用药可能会对胎儿产生一定影响，局部用药相对更安全。要选择对胎儿无影响的抗真菌药物局部制剂进行治疗，用药时需在医生指导下进行，严格遵循医嘱的用药方法和疗程。糖尿病患者：这类患者容易反复出现霉菌性阴炎，除了针对霉菌进行抗真菌治疗外，还需要积极控制血糖。只有将血糖控制在相对稳定的范围内，才能减少霉菌性阴炎的复发几率。在使用抗真菌药物治疗的同时，要定期监测血糖，调整降糖方案。