扁桃体发炎会引发咳嗽，对此应在医师指导下进行药物治疗。具体如下：
一、扁桃体发炎时，扁桃体隐窝内有大量化脓性渗出物，这些渗出物常常流入或滴入气管，从而导致咳嗽。
二、扁桃体炎属于上呼吸道的炎症性感染，由于上下呼吸道属于同一气道，当炎症加重时，可能会累及气管和肺，进而引发气管炎、肺炎等疾病。所以扁桃体炎常引起患者咳嗽，尤其是在扁桃体炎未得到及时治疗，或者患者抵抗力和免疫力相对较低的情况下。此时，需要联合使用镇咳祛痰药物，比如：
1.盐酸氨溴索口服液：可帮助稀释痰液。
2.复方甘草片：起到镇咳作用。
同时，患者必须多喝水，通过大量饮水可以将痰稀释。此外，还需要使用抗生素进行治疗，如：
1.阿莫西林胶囊：这是治疗扁桃体炎常用的抗生素。
2.当部分患者对青霉素类抗生素过敏时，可使用头孢菌素类抗生素，包括：
(1)头孢拉定胶囊。
(2)头孢克洛分散片等。
总之，建议患者在使用药物治疗期间，应严格按照医师指导进行，以免因使用不当而出现其他不适症状。