卵泡萎缩是指卵泡发育到一定阶段后没有正常排出，而是逐渐变小、退化；而卵泡排出则是卵泡发育成熟后从卵巢排出到腹腔，为受精等后续过程创造条件。
形态变化方面
卵泡萎缩时，超声监测可见卵泡不再增大甚至缩小，内部结构逐渐紊乱；卵泡排出前超声可观察到卵泡大小达到一定成熟标准，排出时卵泡壁变薄并向卵巢表面突出。
发生机制差异
卵泡萎缩可能与内分泌失调等因素有关，例如促黄体生成素等激素水平异常影响卵泡正常排出；卵泡排出是体内激素调控的结果，当体内激素达到特定水平时，卵泡壁破裂促使卵泡排出。
对受孕影响不同
卵泡排出是受孕的必要前提，若成功排出且与精子结合则有可能怀孕；卵泡萎缩则会影响受孕，因为无法正常排出与精子相遇结合。
相关因素影响
年龄因素会影响卵泡情况，随着年龄增长，卵泡萎缩的概率可能增加，而年轻女性相对卵泡排出更易处于正常状态；生活方式中，长期熬夜、压力过大等可能导致内分泌紊乱，进而影响卵泡是排出还是萎缩。