验孕棒测出一深一浅但月经来了，可能是生化妊娠。生化妊娠是指精子和卵子结合成受精卵，但受精卵未成功在子宫着床的情况，发生概率约占早期妊娠的30%-50%。
可能的原因分析
激素水平因素
受精卵着床异常： 虽然验孕棒显示一深一浅提示怀孕，但实际上受精卵可能没有成功在子宫腔内着床。此时体内人绒毛膜促性腺激素（hCG）水平有一定升高，但不足以维持妊娠继续，进而出现类似月经的阴道出血。一般hCG水平相对较低，通常低于几百国际单位每升。假阳性情况： 验孕棒可能出现假阳性结果，比如操作不当，像验孕棒浸泡时间过长、周围环境干扰等情况，会导致出现一深一浅的情况，之后却来了月经。这种情况相对较少见，但也需要考虑。
胚胎自身问题
染色体异常： 如果受精卵本身存在染色体数目或结构异常，即使形成了受精卵，也很难正常着床发育，进而出现这种看似怀孕但又来月经的情况。染色体异常是早期胚胎自然淘汰的常见原因之一，在不明原因的生化妊娠中，相当一部分与胚胎染色体异常有关。基因缺陷： 受精卵的基因存在缺陷，也会影响其正常着床和发育，导致出现上述现象。基因缺陷可能是父母遗传因素导致，也可能是受精卵在形成过程中受到外界不良因素影响而产生。
子宫内膜因素
子宫内膜容受性差： 子宫内膜是受精卵着床的场所，如果子宫内膜厚度不合适、容受性差，比如子宫内膜过薄（小于8毫米）或过厚、内分泌环境不佳等，都可能影响受精卵的着床，从而出现这种情况。子宫内膜容受性受多种因素影响，包括体内激素水平、子宫内膜的炎症等情况。子宫内膜病变： 存在子宫内膜息肉、子宫内膜炎等病变时，会影响受精卵的着床环境，使得受精卵无法正常着床，进而出现阴道出血类似月经的情况。例如子宫内膜息肉可能会干扰受精卵的着床位置和着床过程。