尖锐湿疣的治疗难易程度与治疗目的相关。若以实现临床治愈，也就是去除疣体、缓解症状为目标，相对较容易治疗；但若以彻底治愈，即清除HPV病毒、根治尖锐湿疣为目的，则较为困难。
一、临床治愈：
1.若仅以消除疣体和症状作为治疗方向，通常比较容易达成。临床上存在多种治疗手段，可遵医嘱联合运用以提升疗效。对于尖锐湿疣，可以采用诸如激光、微波、电灼烧、光动力疗法等物理方式来去除疣体。
2.也能够运用局部药物进行治疗，像咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b凝胶、酞丁安搽剂等。
3.对于体积较大的疣体，还能借助外科手术等办法去除。在疣体去除后，若6-9个月没有复发，即可视为临床治愈。
二、彻底治愈：
1.要是期望彻底清除HPV病毒以达到根治尖锐湿疣的目的，往往比较困难。
2.当前并没有专门针对HPV病毒的特效药物，治疗药物大多也是以局部用药为主，也可通过系统用药与外用药物联合治疗，但这也只是让病毒载量低于参考下限，而并非完全根除。当人体免疫力下降时，病毒有再次增殖从而导致复发的可能。
总之，尖锐湿疣的治疗在不同目的下难易程度不同，临床治愈相对容易实现，而彻底治愈则面临较大挑战。