病毒性脑膜炎后遗症可能出现多种症状。一般来说，部分患者可能会有认知功能障碍，比如约有10% - 15%的病毒性脑膜炎患者在恢复后会存在不同程度的记忆力减退、注意力不集中等情况。
神经系统方面的症状
认知功能异常： 除了记忆力减退外，还可能表现为计算能力下降，患者在进行简单的算术运算时会变得困难。例如，原本能轻松算出购物账单的金额，患病后却难以快速准确计算。运动功能障碍： 有些患者会出现肢体无力的情况，常见于单侧肢体，比如手臂或腿部力量减弱，拿东西时会感觉使不上劲，严重的可能影响正常的行走能力，导致走路不稳、容易摔倒。
精神心理方面的症状
情绪异常： 部分患者会出现情绪波动较大的情况，可能会经常无故地感到焦虑、抑郁，情绪变得低落，对原本感兴趣的事情提不起兴趣。睡眠障碍： 病毒性脑膜炎后遗症患者还可能有睡眠方面的问题，比如入睡困难，夜间容易惊醒，睡眠质量下降，长期如此会影响身体的恢复和日常生活状态。
其他方面的症状
头痛头晕： 约有20% - 30%的患者会遗留头痛头晕的症状，头痛程度因人而异，有的是轻微的胀痛，有的则较为剧烈，头晕会让患者感觉头重脚轻，在活动后症状可能会加重。癫痫发作： 少数患者可能会出现癫痫发作的情况，表现为突然的肢体抽搐、口吐白沫、意识丧失等，这种情况相对较少，但一旦发生需要及时就医处理。