新生儿先天性心脏病的表现因病情严重程度而异。一般来说，轻度的先天性心脏病可能没有明显表现，而较严重的可能有一些特定症状。比如，约1/3的重症先天性心脏病新生儿在出生后1-2天内就会出现呼吸急促的情况，频率可能超过60次/分钟。
症状表现一：呼吸方面
呼吸急促： 新生儿先天性心脏病较常见的表现之一是呼吸急促。当心脏存在结构异常时，会影响肺部的血液供应和气体交换，导致宝宝呼吸加快。比如一些复杂型先天性心脏病患儿，出生后不久就会出现呼吸频率明显增快，超过正常新生儿的呼吸频率范围（正常新生儿呼吸频率约30-40次/分钟）。口唇发紫： 这也是常见表现。由于心脏供血异常，血液中氧气含量降低，会导致口唇、指甲等部位呈现青紫颜色。尤其是在宝宝哭闹、吃奶等活动后，发紫情况可能会加重。
症状表现二：喂养方面
喂养困难： 患有先天性心脏病的新生儿往往吃奶比较费力。因为心脏功能受影响，宝宝在吃奶过程中需要消耗更多体力来获取足够的氧气和能量，可能会出现吃吃停停、容易呛奶的情况。而且可能会比正常新生儿体重增长缓慢，因为营养物质不能很好地被身体利用。体重不增： 由于心脏病变影响了机体的正常代谢和营养吸收，很多先天性心脏病新生儿体重增长会低于正常水平。即使吃奶量正常，也可能因为心脏功能问题，无法将营养充分输送到全身，导致体重增长停滞或缓慢。
症状表现三：心脏体征方面
心脏杂音： 医生通过听诊可以发现心脏杂音。这是因为心脏结构异常导致血液流动异常产生的声音。不同类型的先天性心脏病可能会有不同特点的杂音，比如室间隔缺损的患儿可能会听到胸骨左缘第3 - 4肋间响亮的全收缩期杂音。心率异常： 部分先天性心脏病新生儿会出现心率过快或过慢的情况。正常新生儿心率一般在120 - 140次/分钟左右，而患有先天性心脏病的宝宝可能心率会高于160次/分钟或者低于100次/分钟。