射精后肚子疼痛可能是前列腺炎、输精管炎、尿道炎等引起，具体病因需到医院完善相关检查来明确。
一、前列腺炎：是由多种复杂原因导致的，以尿道刺激症状和慢性盆腔疼痛为主要表现的前列腺疾病。慢性前列腺炎不论哪种类型，其临床症状统称前列腺炎症候群，包括：
1.盆骶疼痛：表现复杂，疼痛常位于耻骨上、腰骶部、会阴部，放射痛可表现为尿道、精索、睾丸、腹股沟、腹内侧部疼痛，向腹部放射类似急腹症，沿尿路放射类似肾绞痛，易导致误诊。
2.排尿异常：有尿频、尿急、尿痛、排尿不畅、尿线分叉、尿后沥滴、夜尿次数增多，尿后或大便时尿道流出乳白色分泌物等表现。
3.偶尔伴有性功能障碍：包括性欲减退、早泄、射精痛、勃起减弱及阳痿等。对于前列腺炎，首先要进行临床评估确定疾病类型，然后针对病因选择治疗方法，如抗菌、消炎、止痛以及物理治疗等。
二、输精管炎：指输精管的感染性疾病，好发于青少年，可单发或双侧同时受累。分为急性输精管炎和慢性输精管炎：
1.急性输精管炎：患侧阴囊坠胀疼痛、皮肤红肿，疼痛放射至腹部及同侧大腿根部，常使患者曲腰捧腹，阴囊局部压痛明显，输精管触痛明显，严重者可伴发热，输精管周围可形成化脓性病灶。
2.慢性输精管炎：患侧阴囊坠胀疼痛或红肿，疼痛放射至腹部、大腿根部，临床症状比急性输精管炎轻，起病缓慢且有反复发作史，常伴发睾丸、附睾炎，输精管损伤或施行输精管结扎术后发生的输精管炎结节，以结节为中心向两端发展，输精管增粗或粘连，结节可为痛性结节或无症状性结节。在急性炎症期应卧床休息，将阴囊抬高促进局部血液回流，根据可能感染的病原体种类选择敏感抗生素，局部坠胀疼痛明显者可用止痛药，严重者可采用精索封闭治疗，对于输精管结扎后的顽固性痛性结节可手术切除。
三、尿道炎：指由淋球菌或非淋球菌的病原体引起的急慢性尿道炎症，通常表现为尿道刺痒、尿频、尿急、尿痛、尿道分泌物，急性发作时耻骨上区和会阴部伴有钝痛，可通过性接触传播。尿道炎主要通过抗菌药治疗，针对不同类型使用的抗菌药有所差异，治疗的主要目标是阻断传播，同时避免自身感染加重和出现并发症，患者配偶也需同时治疗。
总之，射精后肚子疼痛的原因多样，需明确诊断后进行针对性治疗。