阴茎上长小肉疙瘩可能是尖锐湿疣、阴茎珍珠疹、传染性软疣等疾病引起，也可能是其他原因导致。具体如下：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。尖锐湿疣通常表现为阴茎、龟头、冠状沟等部位的单个或多个小肉疙瘩，呈乳头状、菜花状或鸡冠状，表面粗糙，质地柔软，容易出血。尖锐湿疣具有传染性，可通过性接触传播给他人，也可通过间接接触传播，如使用感染者的衣物、毛巾、浴缸等。
2.阴茎珍珠疹：是一种常见的男性生殖器官良性病变，病因尚不清楚，可能与生理发育变异、包皮过长、局部刺激等因素有关。阴茎珍珠疹主要表现为阴茎冠状沟边缘的珍珠状、半透明或白色的小丘疹，通常无自觉症状，一般不需要治疗。
3.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，主要通过直接接触传播，也可通过间接接触传播，如使用感染者的衣物、毛巾等。传染性软疣通常表现为圆形或半球形的丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质，具有传染性。
4.其他：阴茎上长小肉疙瘩还可能是皮脂腺异位症、扁平湿疣、鲍恩样丘疹病、阴茎中线囊肿等疾病引起。
如果发现阴茎上长小肉疙瘩，建议及时就医，明确诊断。如果是尖锐湿疣，需要及时治疗，以免病情加重。治疗方法包括药物治疗、物理治疗、手术治疗等。如果是阴茎珍珠疹、皮脂腺异位症等疾病，一般不需要治疗，但需要注意局部清洁卫生，避免搔抓、摩擦等刺激。如果是其他疾病，需要根据具体情况进行治疗。