尿尿后疼痛可能由多种原因引起，比如泌尿系统感染，据统计，女性泌尿系统感染发生率相对较高，尤其是性生活活跃期女性。
泌尿系统感染导致的尿尿后疼痛
膀胱炎：主要由大肠埃希菌等细菌感染引起，除了尿尿后疼痛，还可能有尿频、尿急等症状。患者会感觉膀胱部位有不适感，排尿时这种疼痛会在结束后较为明显。尿道炎：分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。淋菌性尿道炎多由淋病奈瑟菌感染，会出现尿道脓性分泌物，尿尿后疼痛明显；非淋菌性尿道炎常见病原体是沙眼衣原体等，症状相对较轻，但也会有尿尿后疼痛、尿道瘙痒等表现。
泌尿系统结石引发的尿尿后疼痛
尿道结石：多来自肾和膀胱的结石排入尿道。患者会有排尿困难，而且在排尿过程中会出现尿尿后疼痛，有时还能感觉到尿道内有异物感。膀胱结石：主要症状是排尿中断和尿尿后疼痛，改变体位后可能继续排尿。结石刺激膀胱黏膜，会导致尿尿后的疼痛感觉。
其他原因造成的尿尿后疼痛
前列腺炎：多见于中青年男性，急性前列腺炎会有尿频、尿急、尿痛，尿尿后疼痛可能伴有会阴部、耻骨上区疼痛；慢性前列腺炎则症状相对迁延，尿尿后可能会有尿道不适、疼痛等感觉。外伤：如果尿道受到外力撞击等外伤，也会出现尿尿后疼痛，可能还伴有局部肿胀等表现。