新生儿乳糖不耐受主要表现为消化道相关症状。一般来说，新生儿乳糖不耐受时，常见的表现有以下这些：
胃肠道方面的表现
腹泻： 这是比较典型的症状之一，通常每天腹泻次数可达数次到十余次不等，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫较多，有奶块。比如有的新生儿一天腹泻7 - 8次，大便性状明显异常。腹胀： 新生儿的肚子可能会鼓鼓的，看起来比较胀。这是因为肠道内乳糖不能被正常消化吸收，在肠道内被细菌分解发酵产生气体，导致腹胀。
其他伴随表现
哭闹不安： 由于腹部不适，新生儿可能会不停地哭闹，难以安抚。因为肚子不舒服，所以通过哭闹来表达自己的难受。吐奶： 部分新生儿会出现吐奶的情况，可能在吃奶后不久就吐出，吐奶量多少不一。这可能与乳糖不耐受引起的胃肠道功能紊乱有关。
不同类型的表现差异
原发性乳糖不耐受： 多是由于新生儿体内缺乏乳糖酶，从出生后就可能出现上述消化道症状，一般在喂养含乳糖的母乳或配方奶后很快出现表现。继发性乳糖不耐受： 常继发于肠道感染等情况，比如新生儿感染了某些肠道病毒后，肠道黏膜受损，导致乳糖酶暂时分泌减少，进而出现乳糖不耐受的表现，往往在肠道感染后逐渐出现类似腹泻、腹胀等症状。