百日咳主要靠抗生素治疗来控制病情，一般确诊后应尽早使用抗生素，如红霉素，通常用药后1~2周传染性会逐渐消失。
抗生素治疗是关键
首选药物：红霉素是治疗百日咳的常用抗生素，它能抑制百日咳杆菌的生长繁殖。另外，阿奇霉素也可用于百日咳的治疗，对百日咳杆菌有较好的作用。用药时间：一般需要连续用药7~10天左右，要严格按照医嘱用药，不能自行停药，否则可能影响治疗效果，导致病情反复。
对症支持治疗很重要
止咳祛痰：对于咳嗽剧烈且有痰的患儿，可使用止咳祛痰药物，如氨溴索口服液，它能稀释痰液，促进痰液排出，缓解咳嗽症状。但2岁以下幼儿使用时需在医生指导下进行，因为不同年龄段的幼儿对药物的耐受和反应不同。保持呼吸道通畅：若患儿出现呼吸急促等情况，要及时清理呼吸道分泌物，必要时可通过吸氧等方式来维持呼吸道通畅，保证患儿能正常呼吸，避免因缺氧导致病情加重。
隔离与护理不可忽视
隔离措施：百日咳具有传染性，确诊后患儿应隔离治疗，一般从发病起隔离40天左右，这样可以防止将病菌传染给他人，尤其是未接种过百日咳疫苗的人群。日常护理：患儿需要多休息，保持室内空气清新、温度适宜。饮食上要给予营养丰富、易于消化的食物，保证患儿有足够的营养摄入来抵抗疾病，但要避免一次性进食过多，以免引起呕吐等不适。同时，要密切观察患儿的病情变化，如咳嗽频率、呼吸情况等，如有异常及时告知医生。
特殊人群需特别关注
婴幼儿群体：百日咳对婴幼儿的危害相对较大，因为他们的免疫系统发育还不完善。如果婴幼儿确诊百日咳，更要严格按照医生的治疗方案进行治疗，并且在护理过程中要更加精心，一旦出现呼吸困难等严重症状要立即送医救治。孕妇感染：孕妇如果感染百日咳，也需要及时治疗，因为孕妇感染后可能会影响自身健康以及胎儿的发育。治疗时要选择对胎儿影响较小的药物，医生会根据孕妇的具体情况谨慎选择合适的治疗方案。