女性支原体感染后，不同部位感染症状有所不同。比如泌尿生殖道感染时，约50%的患者会有尿道刺痒、尿频等症状，部分人症状可能持续数周甚至数月。
泌尿生殖道感染症状
尿道感染表现： 女性尿道较短，感染支原体后可能出现尿道刺痒，通常程度较轻，有的患者还会感觉尿道有轻微灼热感。同时，可能出现尿频现象，即排尿次数较平时增多，但每次尿量可能不多。部分患者症状不典型，可能仅表现为偶尔的尿道不适。宫颈感染表现： 宫颈是女性生殖系统的重要部位，支原体感染宫颈时，宫颈可能出现充血、水肿等情况。患者可能有白带增多的症状，白带性状可能发生改变，比如变得黏稠，颜色也可能稍有异常，但一般没有明显臭味。有的患者还可能出现接触性出血，即在性生活后或妇科检查后出现少量阴道出血。
呼吸道感染症状
轻症呼吸道感染： 如果是支原体引起的呼吸道轻度感染，女性可能先出现咽痛、头痛等症状，这些症状相对比较轻微，容易被忽视。随后可能会有咳嗽，多为干咳，也就是没有明显咳痰的咳嗽，咳嗽程度可轻可重，有的患者只是偶尔轻咳，有的则会频繁咳嗽影响日常生活。重症呼吸道感染： 当呼吸道感染较重时，咳嗽会加重，可能出现剧烈咳嗽，甚至影响睡眠和进食。还可能伴有发热症状，体温一般在37.5℃~39℃左右，发热持续时间因人而异，有的可能持续数天。严重时还可能出现呼吸困难等表现，不过这种情况相对较少见。
其他部位感染症状
盆腔感染： 若支原体感染波及盆腔，女性可能出现下腹部疼痛，疼痛程度不一，有的是隐痛，有的可能较为明显。还可能伴有月经紊乱，比如月经周期延长或缩短，月经量也可能发生变化。部分患者会有乏力、疲劳等全身症状，感觉身体没力气，精神状态不佳。眼部感染： 比较少见的情况是支原体感染眼部，可能出现眼部充血、发红，有异物感，眼睛分泌物增多等症状，比如眼睛老是有眼屎，且眼屎可能较黏稠。