板蓝根颗粒和复方板蓝根主要在药物组成成分、药物功效、适应症等方面存在区别。其中，板蓝根颗粒由板蓝根、糊精、蔗糖等成分构成；复方板蓝根除含有板蓝根成分外，还包含大青叶等中药。在药物功效方面也有所不同：板蓝根能够清热解毒、凉血、利咽，对呼吸道感染效果较好，可用于治疗咽喉肿痛、口腔溃疡、急性扁桃体炎等症状；复方板蓝根的治疗方向较为多样，除能应对咽喉肿痛、口腔溃疡、急性扁桃体炎等症状外，还可治疗部分由炎症引起的感染。板蓝根更适合用于肺肾热导致的咽喉肿痛等症状，而复方板蓝根颗粒则更适宜用于风热感冒引起的咽喉肿痛等症状。
此外，两种药物在服用期间都不适合与滋补性中药同时服用，患有糖尿病、高血压、心脏病、肾病等慢性病的患者以及孕妇、儿童、脾虚便溏的人群均需在医生指导下使用。
总之，在使用这两种药物时，要注意区分它们的不同之处，根据具体症状和自身情况合理选择，并遵循相关的用药注意事项。