一般来说，眼睛进了小飞虫可能会引发眼睛异物感、结膜炎、角膜炎等状况，可通过一般治疗、药物治疗等方式来改善症状。具体如下：
一、眼睛出现异物感：当小飞虫进入眼睑内导致异物感时，可以轻轻闭眼一段时间，或者用手轻轻提起上眼皮，通常附在表面的眼睛异物会随着眼泪自行排出。
二、结膜炎：进入眼睑内的小飞虫在眼内活动可能对结膜产生刺激，从而出现红肿症状。此时可以用清水冲洗眼睛，将小飞虫冲出。同时要遵医嘱使用药物治疗，常见的药物包括妥布霉素滴眼液、阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦眼膏等。
三、角膜炎：小飞虫进入眼睛后若附着在角膜上，有可能引发角膜炎症。这种情况下建议到医院由专业医生取出，并遵医嘱配合药物进行治疗，常见药物有左氧氟沙星眼药水、氧氟沙星眼药水、那他霉素滴眼液等。
总之，如果眼睛里进了小飞虫且出现不适症状，建议患者及时就医，以便进行针对性的治疗。