发烧即发热，感冒发烧时眼睛疼可能有以下原因。
一、病毒感染：感冒多由病毒感染引起，如副流感病毒、鼻病毒、流感病毒等。病毒在体内大量繁殖会导致基础体温持续升高，眼部血流量持续加快，进而使眼角膜充血，引起眼睛疼痛、肿胀等症状。此时可在医生指导下使用利巴韦林分散片等抗病毒药物、对乙酰氨基酚片等解热镇痛药、氨酚黄那敏片等缓解感冒症状的药物，这些药物能起到抗病毒、解痉、退热等作用。
二、睡眠欠佳：患病期间若没有保证规律充足的睡眠，眼部过度劳累也会引发眼睛疼痛，所以保证良好的睡眠至关重要。
三、眼部炎症：眼部存在炎症病变时，在炎症刺激下可出现结膜出血、水肿、疼痛等情况。可在医生指导下使用盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物进行治疗，以发挥抗感染的作用。
此外，还可能是外伤刺激、免疫系统异常、三叉神经痛等原因导致，需要针对具体原因进行治疗。总之，感冒发烧眼睛疼的原因多样，应明确原因后采取相应的治疗措施。