怀孕5周肚子有点隐隐作痛，可能存在以下情况：一是生理性表现，即受精卵着床过程中对子宫有轻微刺激，若没有腹胀、阴道出血等不良症状则属此情况；二是受凉，平时未做好腹部保暖致腹部受凉引起腹壁肌肉痉挛；三是先兆流产，伴有阴道褐色出血，可能是胚胎绒毛与宫腔分离过程中对子宫产生刺激所致。
一、生理性表现：
受精卵在着床时，确实会对子宫造成一定程度的轻微刺激，从而出现怀孕5周肚子隐隐作痛的现象。这种情况下，通常仅仅只有腹部的隐痛感，而不会有腹胀、阴道出血等其他异常表现，所以可以判断为生理性的。
二、受凉：
如果在日常生活中，没有很好地对腹部进行保暖工作，那么就有可能让腹部遭受寒冷的侵袭，进而导致腹壁肌肉发生痉挛，也就会引发怀孕5周肚子有点隐隐作痛。一般来说，在采取了有效的腹部保暖措施之后，这种隐隐作痛等不适症状能够逐渐得到改善。
三、先兆流产：
当怀孕5周肚子出现隐隐作痛，并且同时伴有阴道褐色出血的情况时，那就需要考虑与先兆流产有关了。这很可能是由于胚胎绒毛与宫腔进行分离的过程中，对子宫产生了刺激所引起的。
总之，怀孕5周肚子隐痛可能是正常生理现象，也可能存在其他问题，要密切观察是否伴有其他症状，必要时及时就医检查和处理。