萎缩性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，一般会用到抑酸剂、胃黏膜保护剂等。比如常用的抑酸剂有质子泵抑制剂，像奥美拉唑，它能抑制胃酸分泌，减少胃酸对胃黏膜的刺激，一般可以缓解因胃酸过多导致的胃部不适等症状。
抑酸药物
质子泵抑制剂：这类药物能强效抑制胃酸分泌，常见的有奥美拉唑、兰索拉唑等。它们通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后步骤，从而减轻胃酸对胃黏膜的侵蚀，一般疗程可能在4-8周左右。H₂受体拮抗剂：如雷尼替丁、法莫替丁等，通过阻断组胺H₂受体来抑制胃酸分泌，作用相对质子泵抑制剂稍弱一些，适用于轻至中度萎缩性胃炎患者的胃酸控制。
胃黏膜保护剂
铋剂：像枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，隔绝胃酸、胃蛋白酶等对胃黏膜的损伤，还能杀灭幽门螺杆菌，一般服用后可能会出现舌苔和大便发黑的情况，这是正常现象，停药后会消失。铝碳酸镁：能中和胃酸，同时吸附胆汁，保护胃黏膜免受胆汁的损伤，服用后可能在半小时左右就起效，缓解胃部不适症状。
促胃肠动力药
多潘立酮：可以促进胃排空，改善腹胀、早饱等症状，一般在饭前15-30分钟服用，能增强胃蠕动，帮助食物向下推进。莫沙必利：也是促进胃肠动力的药物，作用机制与多潘立酮类似，但对全胃肠道的动力促进作用可能更强一些，适用于伴有消化不良症状的萎缩性胃炎患者。
抗幽门螺杆菌药物
如果萎缩性胃炎伴有幽门螺杆菌感染，就需要进行抗幽门螺杆菌治疗，通常采用联合用药方案，比如质子泵抑制剂+铋剂+两种抗生素，常用的抗生素有阿莫西林、克拉霉素等。不过抗生素的使用需要严格遵循医嘱，因为要根据患者的具体情况和药物敏感试验等选择合适的抗生素，而且要注意抗生素的副作用以及可能的耐药情况等。