灰指甲可通过局部用药、口服用药、手术拔甲、激光治疗等方式来清除。
一、局部用药：当远端受损甲板小于50%且受累指甲数目小于4个时，可选用局部用药。比如阿莫罗芬搽剂，其可渗透甲板并在其中弥散，对多种真菌有抑制作用；酮康唑则能抑制真菌细胞膜麦角甾醇的生物合成，影响细胞膜的通透性。
二、口服用药：若局部用药效果欠佳，可配合口服用药。其中特比萘芬通过抑制真菌细胞膜的形成来发挥抗真菌作用；伊曲康唑可抑制真菌细胞色素P450依赖酶的活性，从而抑制真菌生长繁殖。
三、手术拔甲：对于嵌甲以及甲板厚度大于2mm且远端甲板受累的情况，可采取手术拔甲，之后通常还需联合局部用药或口服用药，以提高疗效并防止复发。
四、激光治疗：激光对病原菌有一定抑制效果，在医生指导下选择合适的激光治疗方式，能起到抑制真菌的作用。
总之，以上提及的各种药物都必须在医生指导下使用，切不可自行盲目用药。