月经过后小腹疼的原因主要有以下几种：一是子宫内膜异位症，二是炎症刺激，三是其他一些因素。
一、子宫内膜异位症：子宫内膜异位症会有渐进性痛经的表现，疼痛主要在下腹深部和腰骶部。同时还可能伴有月经不调以及性交疼痛等症状，这就容易导致月经过后出现小腹疼。子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位，如卵巢、输卵管、子宫肌层等，在月经周期中，这些异位的子宫内膜也会像正常子宫内膜一样发生周期性出血、脱落等变化，但由于这些血液不能像子宫腔内的经血那样经阴道排出体外，而是积聚在局部，从而刺激周围组织引起疼痛。
二、炎症刺激：
1.盆腔炎：如果患有盆腔炎，受到炎症刺激会出现白带增多、外阴瘙痒等情况，下腹部也会有疼痛表现，进而引起月经过后小腹疼。盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症。
2.附件炎：当有附件炎时，炎症刺激同样会导致一系列症状，包括白带异常和下腹部疼痛，这种情况下月经过后也可能引发小腹疼。附件炎是指输卵管和卵巢的炎症。
三、其他原因：
(1)腹部受凉受寒：月经过后如果腹部受到寒冷刺激，可能会导致子宫的平滑肌痉挛或者腹部肌肉痉挛，从而引起小腹疼。
(2)食用生冷食物：吃了生冷食物后，也可能会有类似情况发生。
总之，月经过后小腹疼可能是由多种原因引起的，需要结合具体情况进行分析和诊断，以便采取合适的治疗措施。