新生儿喉咙有痰可能是多种原因引起的。一般来说，新生儿的呼吸系统发育还不完善，气道较窄，容易出现分泌物积聚的情况。比如，大约有20%-30%的健康新生儿可能会出现喉咙有痰的现象。
生理因素导致
吞咽功能不完善： 新生儿的吞咽功能还没发育成熟，不能很好地将口腔内的分泌物吞咽下去，就容易导致喉咙有痰的感觉。他们的唾液腺分泌的唾液不能及时咽下，就会在喉咙处积聚。气道狭窄： 新生儿的气道相对较窄，气管、支气管管径比成人细，这使得少量的分泌物也容易感觉像是有痰。而且气道黏膜比较娇嫩，容易受到刺激产生分泌物。
环境因素影响
空气干燥： 如果室内空气过于干燥，湿度低于40% - 60%的适宜范围，就会使新生儿呼吸道黏膜干燥，导致分泌物变得黏稠，不容易排出，从而感觉喉咙有痰。比如在秋冬季节，若没有使用加湿器，空气干燥时这种情况更易发生。空气污染： 室内如果有吸烟的人，烟雾中的有害物质会刺激新生儿的呼吸道，导致呼吸道分泌物增多，出现喉咙有痰的情况。另外，空气中的粉尘等污染物也会刺激新生儿的呼吸道，引发分泌物增加。
疾病因素引发
上呼吸道感染： 新生儿免疫力较低，容易受到病毒等病原体的侵袭引发上呼吸道感染。感染后，呼吸道黏膜会充血、水肿，分泌增多，从而出现喉咙有痰的症状，同时可能还伴有鼻塞、流涕等表现。先天性喉软骨发育不良： 部分新生儿由于先天性喉软骨发育不良，会导致喉部结构异常，影响气道通畅，也会使喉咙有痰，这种情况一般在出生后不久就可能出现，随着年龄增长，部分可自行缓解，但需要密切观察。