一般来说，巧克力囊肿（即卵巢子宫内膜异位囊肿）经合理治疗有一定几率可实现根治。卵巢子宫内膜异位囊肿是因异位的子宫内膜在卵巢生长，伴随月经周期出血而形成存有陈旧性积血的囊肿。
一、卵巢子宫内膜异位囊肿的治疗方法：
1.药物治疗：患者必须在医生指导下用药，切不可自行用药。常用药物包括：布洛芬，能缓解疼痛；屈螺酮炔雌醇片、去氧孕烯炔雌醇片，可调节激素水平；地诺孕素片，对病情有一定作用；散结镇痛胶囊、通迪胶囊等，有助于改善症状。
2.手术治疗：其主要目的是切除病灶并恢复正常解剖结构，医生会依据患者症状、病变部位、有无生育需求等多方面因素，综合考量来选取合适的手术方式，常用的手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术。
二、卵巢子宫内膜异位囊肿的病因：其病因尚不明确，可能与以下因素有关：
1.经血逆流，这可能导致子宫内膜异位。
2.体腔上皮化生。
3.家族遗传，有一定遗传倾向。
4.体内雌激素水平异常，会影响病情发展。
5.下生殖道梗阻。
6.自身免疫性疾病。
总之，对于卵巢子宫内膜异位囊肿，要了解其治疗方法和病因，以便更好地进行诊断和治疗。