做双眼皮手术可能出现一些后遗症，比如感染，据统计，大约1% - 5%的人术后可能发生感染情况。一旦感染，局部会出现红肿热痛，严重的还可能有脓性分泌物。
形态不满意
双侧不对称： 这是比较常见的情况，可能是手术设计时两边预留的重睑宽度、形态等不一致，或者是手术操作过程中两边处理有差异导致。比如一边做得宽一些，另一边相对窄，术后恢复后就会明显看出双侧不对称。重睑过宽或过窄： 如果医生手术操作失误，重睑过宽可能会让眼睛看起来很假，像“欧式眼”，不符合东方人的面部特征；而过窄的话，可能达不到原本想要的效果，感觉眼睛还是没什么变化。
疤痕问题
增生性疤痕： 一般在术后1 - 3个月内可能出现，尤其是有疤痕体质的人更容易发生。表现为切口部位的疤痕变红、变厚，隆起于皮肤表面。比如有些人本身是疤痕体质，做完双眼皮后，切口处疤痕明显增生，影响外观。疤痕不明显但有痕迹： 即使不是疤痕体质，术后切口也可能留下细微的痕迹，尤其是恢复较慢的人，切口处可能会有淡淡的线样痕迹，虽然不严重，但对于追求完美的人来说可能不太满意。
眼部功能影响
睁眼乏力： 可能是手术过程中损伤了上睑提肌等组织导致。术后会感觉睁眼比较费力，严重的可能会影响正常的睁眼功能，比如抬头看东西时会更费劲。眼睑闭合不全： 少数人术后可能出现眼睑闭合不全的情况，尤其是做了全切双眼皮且去皮去脂较多的人。睡眠时可能会有角膜暴露，长时间可能会导致角膜干燥、发炎等问题，影响眼睛的健康。