肝内胆管结石的治疗需根据病情而定，一般无症状的肝内胆管结石定期复查即可，有症状或并发症时可能需要手术等治疗。对于部分患者，手术是较为有效的治疗方式，如肝部分切除术，适用于结石集中在某一肝叶、肝段且伴有肝组织萎缩的情况，约有20% - 30%的患者可能需要这类手术。
观察随访治疗
无症状且结石较小者： 如果肝内胆管结石患者没有明显症状，结石也比较小，通常建议每6 - 12个月进行一次腹部B超检查，监测结石的变化情况。比如结石直径小于1厘米，且没有引起胆管梗阻、感染等情况，可先采取定期观察的策略。饮食注意： 在观察随访期间，患者要注意饮食规律，避免暴饮暴食，减少高脂肪、高胆固醇食物的摄入，像动物内脏、油炸食品等应尽量少吃，保持健康的生活方式有助于控制病情发展。
手术治疗情况
胆管切开取石术： 这是针对肝内胆管结石的常见手术方式之一。手术中会切开胆管，直接取出结石，适用于胆管结石相对集中、胆管狭窄不严重的患者。一般术后需要放置T管引流，引流时间大约为2周 - 3周，但具体时间会因患者恢复情况有所不同。胆肠吻合术： 当肝内胆管结石合并胆管狭窄时，可能需要做胆肠吻合术，通过建立胆管与肠道的通道，来改善胆汁引流，防止结石再次形成。不过该手术可能会有胆肠吻合口漏等并发症的风险，发生率约为5% - 10%左右。
其他辅助治疗
内镜治疗： 对于肝内胆管结石伴有胆总管结石的患者，可考虑内镜下逆行胰胆管造影（ERCP）取石。这种方法是通过口腔、食管、胃到达十二指肠，找到胆管开口，插入导管将结石取出。但内镜治疗有一定的适应证，比如结石直径一般小于2厘米，且胆管下端没有严重狭窄等情况，成功率大约在80% - 90%。药物辅助： 在治疗过程中，若患者伴有胆管炎，可能会使用抗生素来控制感染，常用的抗生素有头孢菌素类等。不过药物只是辅助治疗手段，不能从根本上解决结石问题，且使用抗生素要根据药敏试验等结果合理选择，避免滥用导致耐药等问题。