女性内分泌失调可使用的药物需根据具体病因来定。比如因雌激素缺乏引起的内分泌失调，常用药物有雌激素类药物，像结合雌激素片等，一般需要在医生评估后使用，通常是按疗程服用。
调节雌激素相关内分泌失调的药物
雌激素补充剂： 结合雌激素片可用于缓解因雌激素缺乏导致的一系列内分泌失调症状，如潮热、盗汗等。但这类药物有一定禁忌，有雌激素依赖性肿瘤病史的女性禁用。孕激素类药物： 黄体酮胶囊可用于调节因孕激素不足引起的内分泌失调，比如月经不调等情况。不过，严重肝肾功能不全者禁用黄体酮胶囊。
调节甲状腺相关内分泌失调的药物
甲状腺激素替代药物： 左甲状腺素钠片用于治疗甲状腺功能减退引起的内分泌失调。对于孕妇，在甲状腺功能减退时需要合理使用左甲状腺素钠片来维持甲状腺功能正常，但要注意剂量调整需在医生严格指导下进行。抗甲状腺药物： 甲巯咪唑片用于治疗甲状腺功能亢进引起的内分泌失调。但白细胞严重缺乏、对甲巯咪唑过敏的患者禁用该药物。
调节肾上腺相关内分泌失调的药物
糖皮质激素： 泼尼松片可用于治疗肾上腺皮质功能减退等引起的内分泌失调。然而，严重的精神病史、癫痫、活动性消化性溃疡等患者禁用泼尼松片。盐皮质激素： 氟氢可的松片用于治疗肾上腺皮质功能减退导致的醛固酮分泌不足引起的内分泌失调。但高血压、低血钾患者禁用氟氢可的松片。