经常头疼时，可根据具体情况选择不同检查。若怀疑是脑部病变导致，可先做头颅CT，能初步排查脑出血、脑梗死、颅内占位等情况；若想更清晰看脑部血管、神经等细节，磁共振成像（MRI）是较好选择，它对脑部软组织等显示更优；对于怀疑血管因素引起的头疼，脑血管造影可明确脑血管形态及是否存在狭窄、畸形等；若考虑是鼻窦炎等五官科疾病引发头疼，鼻窦CT能帮助诊断鼻窦情况。
一、头颅CT检查
头颅CT检查速度较快，能快速发现颅内较大的病变，如急性脑出血可在CT上清晰显示高密度影，脑梗死早期也能初步判断，但对于一些微小病变或早期脑梗死可能不如MRI敏感。在儿童中，若头疼怀疑颅内病变，头颅CT也是常用初步检查手段，但需注意辐射影响，不过单次检查辐射剂量在安全范围内。
二、磁共振成像（MRI）检查
MRI对脑部软组织、血管、神经等显示效果更好，能发现头颅CT不易察觉的病变，如早期脑梗死、某些颅内感染、脱髓鞘病变等。对于头疼怀疑有脑部神经、血管细微病变的情况，MRI更具优势。但体内有金属植入物（如心脏起搏器、金属假牙等）的患者不能做MRI检查，需提前告知医生自身情况。
三、脑血管造影检查
脑血管造影可清晰显示脑血管的走行、形态及有无狭窄、动脉瘤、血管畸形等情况，对于怀疑血管病变导致头疼的患者，如蛛网膜下腔出血怀疑动脉瘤破裂等，是重要的检查方法。不过该检查是有创检查，有一定风险，如造影剂过敏、穿刺部位出血等风险。
四、鼻窦CT检查
当头疼伴有鼻塞、流涕等鼻部症状时，鼻窦CT能明确是否存在鼻窦炎、鼻窦肿瘤等鼻部病变，因为鼻窦病变可能引发头疼。儿童若头疼怀疑与鼻窦相关，做鼻窦CT时同样要注意辐射防护，可通过合理 shielding 减少对儿童的辐射影响。