肠神经官能症的治疗需综合多方面来进行。一般来说，可通过心理调节、药物辅助等方式来改善。
心理调节很重要
保持良好心态：患者要尽量避免长期处于紧张、焦虑、抑郁等不良情绪中。比如每天可以花15 - 30分钟进行冥想，让自己身心放松，这有助于缓解肠神经官能症的症状。规律生活作息：保证充足的睡眠，每天睡眠时长保持在7 - 8小时左右。合理安排工作和休息时间，避免过度劳累，规律的生活能让肠胃功能更稳定。
药物辅助治疗
调节胃肠动力药物：常用的有多潘立酮，它可以促进胃肠蠕动，改善腹胀、早饱等症状。还有莫沙必利，能增强胃肠道运动，加快胃排空，对肠神经官能症引起的消化不良等情况有一定缓解作用。调节肠道菌群药物：像双歧杆菌四联活菌片，它能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，对于肠神经官能症导致的肠道功能紊乱有帮助。还有乳酸菌素片，可在肠道形成保护层，阻止病原菌、病毒的侵袭，促进有益菌生长，改善肠道功能。
饮食调整不可忽视
均衡饮食：保证每天摄入谷类、蔬菜、水果、肉类、奶制品等各类食物。例如每天应摄入300 - 500克谷类食物，200 - 300克蔬菜（深色蔬菜占一半以上），200 - 300克水果。避免刺激性食物：减少食用辛辣、油腻、生冷的食物，如辣椒、油炸食品、冰淇淋等。这类食物容易刺激胃肠道，加重肠神经官能症的不适症状。同时，要少喝浓茶、咖啡等刺激性饮品。