龟头流脓通常由淋菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎、包皮龟头炎等疾病引起，治疗方法因病因不同而异：
一、淋菌性尿道炎：
1.急性淋菌性尿道炎治疗，首选头孢曲松钠肌内注射，或大观霉素肌内注射；也可口服头孢克肟。
二、非淋菌性尿道炎：
1.治疗要遵循尽早、足量、规则的原则。
2.目前主选药物为四环素类、大环内酯类和喹诺酮类。如多西环素、阿奇霉素、氧氟沙星等。
三、包皮龟头炎：
1.治疗应依据不同病因采取不同方法，首先需按具体情况去除病因。
(1)保持局部清洁卫生，局部可用碘伏溶液或消炎软膏涂抹。
(2)念珠菌性龟头炎局部可用克霉唑或酮康唑霜涂抹。
(3)阴道毛滴虫感染者可口服甲硝唑。
2.当患者感染较重，疑有坏死性龟头炎伴发热和腹股沟淋巴结肿大时，需全身应用抗生素。
患者一旦发现龟头流脓，应尽快就医，并遵医嘱进行相关检查以明确诊断。医生会根据具体病因给予相应治疗方案。若有性伴侣，应一同就医，医生会根据诊断和具体情况判断性伴侣是否需要同时接受治疗。总之，对于龟头流脓的情况，需及时诊断并采取针对性治疗措施。