怀孕早期的3个月左右是胎儿容易发生畸形的关键时期。在这个阶段，胚胎正处于快速分化形成各种器官的重要阶段，对外界因素的影响非常敏感。
胚胎器官形成期：受孕后3~8周
细胞分化关键期： 受孕后的3~8周，是胚胎发育的关键时期，这个时候受精卵不断进行分裂，逐渐分化出不同的器官系统。比如心脏在受孕后第22天左右开始形成，到第28天基本形成雏形；肢体的发育也在这个阶段开始，手和脚的雏形在受孕后4周左右出现。如果此时受到不良因素影响，就容易导致器官发育异常。药物影响显著： 此时期如果孕妇服用了一些有致畸风险的药物，像抗肿瘤药物、某些抗生素等，会大大增加胎儿畸形的概率。例如，孕妇服用维A酸类药物，可能会导致胎儿出现颅面部畸形、心脏畸形等问题。
受孕前3周内：虽未显怀但也需注意
受精卵着床前后： 在受孕后的前3周内，其实受精卵还处于着床阶段，这时候如果孕妇接触了放射性物质，比如接受了X线检查，或者感染了某些病毒，像风疹病毒等，也可能影响胚胎的正常发育。因为此时虽然孕妇可能还没有明显的怀孕迹象，但胚胎已经开始了最初的发育进程，放射性物质和病毒都可能干扰细胞的正常分裂和分化。不良生活习惯影响： 这个阶段如果孕妇大量吸烟、酗酒，烟草中的尼古丁和酒精都会通过胎盘影响胚胎，增加胎儿未来出现发育问题的风险。比如长期酗酒的孕妇，胎儿可能会出现胎儿酒精综合征，表现为生长发育迟缓、智力低下等。
孕中晚期相对风险降低但仍需留意
相对风险降低： 怀孕到了中晚期，胎儿的大部分器官已经基本形成，但是一些系统还在继续发育完善，比如神经系统。不过这个时期也不是完全没有风险，如果孕妇出现严重的妊娠并发症，像妊娠期高血压疾病控制不佳，也可能影响胎儿的生长发育，导致胎儿出现宫内发育迟缓等问题。营养因素仍重要： 孕中晚期孕妇如果营养不均衡，缺乏某些重要营养素，比如缺乏叶酸，虽然早期补充叶酸主要是预防神经管畸形，但孕中晚期如果缺乏叶酸，也可能影响胎儿的神经系统发育以及其他器官的功能完善。所以孕中晚期孕妇仍需要合理膳食，保证营养充足。