皮埋避孕是将避孕药埋入皮下，缓慢释放激素来达到避孕效果，不过它也有一些副作用。一般来说，皮埋避孕可能有月经方面的副作用，大约有20% - 50%的女性在使用皮埋后的前几个月会出现月经紊乱，比如月经周期缩短、经期延长或不规则出血等情况。
月经方面的副作用
经期延长： 部分女性使用皮埋后，经期会比原来延长，可能原本3 - 7天的经期会延长到10天甚至更久，表现为月经淋漓不尽。月经周期改变： 有的女性月经周期会从原来相对规律的28 - 30天变为20天左右，周期明显缩短，打乱了原本的月经规律。
身体不适方面的副作用
头晕乏力： 大概有10% - 20%的女性在使用皮埋后的一段时间内会出现头晕、乏力的感觉，这是因为身体对皮下释放的激素有一个适应过程，部分人会比较明显地感觉到身体没力气，做事容易疲劳。恶心呕吐： 少数女性可能会有恶心、呕吐的症状，一般在刚植入皮埋剂后的短时间内出现，程度轻重不一，有的可能只是偶尔恶心，严重的可能会频繁呕吐，影响日常生活。
其他可能的副作用
情绪变化： 有少部分女性使用皮埋后可能会出现情绪上的变化，比如变得容易焦虑、抑郁等，不过这种情况相对较少见，大概占比在5%以下，但一旦出现也会对生活产生一定影响。体重变化： 个别女性使用皮埋后会出现体重增加的情况，可能是因为激素影响了新陈代谢，但体重增加的幅度因人而异，有的可能增加1 - 2公斤，有的可能增加更多。