早起空腹胃不舒服可能由多种原因引起。比如，约50%的功能性消化不良患者会出现早起空腹胃不舒服的情况。
原因一：胃酸分泌过多
空腹状态下胃内胃酸没有食物中和：正常情况下，胃会分泌胃酸来帮助消化食物，但如果空腹时胃酸分泌过多，就容易刺激胃黏膜，导致胃部不适。比如一些患有胃溃疡、十二指肠溃疡的患者，就常常在空腹时出现胃部疼痛、灼热等不适感觉。而且，长期精神紧张、压力大也可能影响胃酸分泌，导致早起空腹胃不舒服。原因二：胃部疾病胃炎：各类胃炎患者的胃黏膜处于受损状态，空腹时胃内没有食物缓冲，胃酸等刺激物更容易刺激胃黏膜，引发不适。像慢性萎缩性胃炎患者，除了早起空腹胃不舒服，还可能伴有消化不良、食欲减退等症状。胃溃疡：胃溃疡的典型症状之一就是空腹时上腹部疼痛，疼痛性质多样，可为钝痛、胀痛、灼痛等，一般在进食后可缓解，但早起空腹时又会出现。
原因三：饮食因素
前一晚饮食不当：如果前一天晚上进食了过多辛辣、油腻、刺激性食物，或者进食过饱、进食时间过晚，都会加重胃肠负担，导致早起空腹胃不舒服。例如，前一晚吃了大量辣椒，第二天早上就可能感觉胃部有灼烧感且不舒服；进食过饱后，胃处于扩张状态，早起空腹时也可能出现不适。空腹喝刺激性饮品：有些人有早起空腹喝浓茶、咖啡的习惯，这些饮品中的咖啡因等成分会刺激胃黏膜，引起胃部不适。比如空腹喝浓咖啡后，可能会出现胃痛、反酸等情况。