脊髓空洞症的治疗需根据具体情况选择，目前主要有手术治疗和药物辅助治疗等方式。一般来说，手术是改善脊髓空洞症症状的重要手段，而药物多是起到辅助营养神经等作用。
手术治疗方式
枕骨大孔减压术： 适用于因小脑扁桃体下疝导致脊髓空洞的患者，通过扩大枕骨大孔及上颈椎椎板，解除对小脑扁桃体、延髓及脊髓的压迫，改善脑脊液循环，约60% - 70%的患者术后症状可得到不同程度缓解。脊髓空洞分流术： 包括空洞 - 蛛网膜下腔分流、空洞 - 腹腔分流等。其中空洞 - 腹腔分流术是将空洞内的液体引流到腹腔，利用腹腔的吸收功能来减少空洞内压力，一般术后1 - 3个月可观察到空洞缩小，但有一定的感染、分流管堵塞等并发症风险，发生率约5% - 10%。
药物辅助治疗
神经营养药物： 如维生素B12（甲钴胺），它参与神经细胞内核酸和蛋白质的合成，能促进受损神经的修复，可长期服用，每日剂量一般为0.5mg左右，但长期大剂量使用可能会有胃肠道不适等不良反应。还有鼠神经生长因子，能促进神经损伤恢复，不过需肌肉注射，价格相对较高，一支约100 - 200元左右。改善循环药物： 如地巴唑，可舒张血管，改善脊髓的血液循环，一般每次10mg，每日3次，但低血压患者慎用，可能会引起血压进一步降低。
康复治疗辅助
物理治疗： 包括针灸、按摩等。针灸可以通过刺激穴位调节神经功能，一般每周进行2 - 3次针灸治疗，一个疗程10 - 15次。按摩可以促进局部血液循环，每天可进行1 - 2次，每次15 - 20分钟，但对于有脊髓明显受压症状且处于急性期的患者需谨慎，避免加重损伤。康复训练： 针对脊髓空洞导致肢体功能障碍的患者，进行针对性的康复训练。如肢体肌力训练，可让患者进行简单的屈伸肢体动作，每天训练3 - 4次，每次10 - 15分钟，根据患者情况逐渐增加强度，但训练过程中要注意避免过度疲劳。