食管反流主要表现为反酸、烧心等症状，约有50%的胃食管反流病患者会出现反酸，即在无恶心、用力的情况下，胃内酸性物质反流至口腔。
典型症状：烧心与反酸
烧心： 通常是胸骨后有烧灼感，多在进食后1小时左右出现。比如吃完一顿丰盛的晚餐后，过了一会儿就感觉胸口有一股灼热的感觉往上涌。反酸： 是指胃内容物反流到咽部或口腔，感觉有酸性物质涌上来。有的人早上起床后会感觉嘴里有酸酸的味道，这很可能就是食管反流导致的反酸。
其他常见症状：吞咽困难与胸痛
吞咽困难： 有的患者会出现吞咽困难的情况，初期可能是在吞咽固体食物时有梗阻感，随着病情发展，吞咽液体食物也可能会有困难。一般是因为食管反流导致食管痉挛或者食管狭窄引起的。胸痛： 疼痛可发生在胸骨后，疼痛性质多样，有的类似心绞痛。疼痛可能会放射到后背、胸部、肩部等部位，容易被误以为是心脏问题，但和心脏疾病引起的胸痛又有所不同，食管反流引起的胸痛一般在进食后更容易发作。
不典型症状：咳嗽与哮喘
咳嗽： 有些食管反流患者会出现慢性咳嗽，而且用常规的止咳药物治疗效果不佳。这是因为反流的胃酸刺激了咽喉部，引起了咳嗽反射。比如有的患者经常咳嗽，按照感冒或者支气管炎治疗很久都不好，后来经检查发现是食管反流导致的。哮喘： 部分食管反流患者会诱发哮喘发作。反流物刺激气道，导致气道痉挛、狭窄，从而引发哮喘症状，如喘息、气促等。这类患者往往在出现哮喘症状的同时，还伴有烧心、反酸等食管反流的相关表现。