乳腺癌分子分型中，HER2阴性、雌激素受体（ER）和孕激素受体（PR）也阴性的称为三阴性乳腺癌，而ER或PR阳性、HER2阳性的相对预后稍好一些，但不能简单说阴性好或阳性好。一般来说，ER或PR阳性的乳腺癌患者可以考虑内分泌治疗，比如他莫昔芬等药物，这类患者约有60%左右的人受体阳性，预后相对较好；HER2阳性的乳腺癌患者可以用曲妥珠单抗等靶向药物治疗，能改善预后。
三阴性乳腺癌特点
侵袭性较强： 三阴性乳腺癌恶性程度相对较高，复发转移风险相对较高，约15%-20%的早期三阴性乳腺癌患者在2-3年内可能出现复发转移。治疗手段相对局限： 除了手术、化疗外，靶向及内分泌治疗获益较少，主要依赖化疗为主。
ER阳性乳腺癌特点
可内分泌治疗： ER阳性的乳腺癌患者很多可以通过内分泌治疗来控制肿瘤生长，内分泌治疗药物比如他莫昔芬，能阻断雌激素与受体结合，抑制肿瘤细胞生长。预后相对较好： 一般来说ER阳性的乳腺癌患者总体预后比三阴性乳腺癌要好一些，生存时间相对更长。
HER2阳性乳腺癌特点
靶向治疗有效： HER2阳性的乳腺癌患者可以使用曲妥珠单抗等靶向药物，能针对性地作用于HER2过度表达的肿瘤细胞，明显提高患者的生存期和生存质量。复发风险需关注： 虽然有靶向治疗，但HER2阳性乳腺癌患者相对来说仍有一定复发风险，不过通过规范的靶向治疗等综合手段，预后也在不断改善。