月经期头疼的主要原因与体内激素变化密切相关。研究发现，女性在月经期间，体内雌激素水平会发生较大波动，大约有60% - 80%的女性在月经期可能出现头疼症状，这与雌激素变化引发的血管舒缩功能异常有关。
激素变化因素
雌激素波动： 月经前期，女性体内雌激素水平迅速下降，这种变化可能会导致颅内血管扩张，从而引发头疼。例如，在卵泡期结束后，雌激素水平开始回落，部分敏感女性就容易出现头疼症状。前列腺素影响： 月经期间，子宫内膜会合成并释放较多的前列腺素，前列腺素除了会引起子宫收缩外，还能影响脑血管，促使脑血管收缩或扩张，进而导致头疼。
神经递质因素
5 - 羟色胺变化： 5 - 羟色胺是一种与情绪和疼痛感知相关的神经递质。在月经期间，女性体内5 - 羟色胺的浓度会发生改变，当5 - 羟色胺水平下降时，就可能影响疼痛调节机制，引发头疼。有研究表明，约30%的月经期头疼患者存在5 - 羟色胺代谢异常的情况。内啡肽变化： 内啡肽具有镇痛作用，月经期间内啡肽水平的变化也可能与头疼有关。当内啡肽分泌减少时，对疼痛的耐受能力下降，更容易出现头疼症状。
个体差异因素
遗传因素： 如果家族中有女性成员在月经期容易出现头疼情况，那么其他女性成员发生月经期头疼的风险可能会增加。有遗传倾向的女性，其体内的生理调节机制可能存在先天性的薄弱环节，在月经期间更易受到激素等因素影响而出现头疼。生活方式因素： 长期睡眠不足、压力过大、饮食不规律等生活方式问题也会加重月经期头疼的发生。比如，长期熬夜的女性，在月经期间身体的应激能力下降，头疼的发生率可能比作息规律的女性高出40%左右；长期处于高压力状态下的女性，月经期间头疼的程度往往更严重。