脖子两侧疼可能与甲状腺有关，也可能由其他原因引起。以下是一些可能的情况：
1.甲状腺疾病：
亚急性甲状腺炎：可导致颈部疼痛，并可放射至耳、颞枕部，伴有全身不适、乏力、肌肉疼痛，以及发热等症状。
桥本甲状腺炎：起病隐匿，发展缓慢，病程较长，主要表现为甲状腺肿大，质地坚韧，部分患者可有压迫症状，如吞咽困难、呼吸困难、颈部不适等。
甲状腺功能亢进：部分患者可出现颈部疼痛，多位于甲状腺部位，可伴有甲亢的其他症状，如心悸、手抖、多汗、消瘦、易激动等。
2.颈部肌肉劳损：长时间保持同一姿势、颈部过度劳累或受到外伤等，可导致颈部肌肉劳损，出现疼痛、僵硬等症状。
3.淋巴结炎：颈部淋巴结炎可导致颈部淋巴结肿大、疼痛，常伴有发热、咽痛等症状。
4.其他原因：
颈椎疾病：如颈椎间盘突出、颈椎管狭窄等，可刺激或压迫颈部神经，引起颈部疼痛。
感染：如扁桃体炎、咽炎等，可通过淋巴管扩散至颈部淋巴结，引起颈部疼痛。
肿瘤：颈部肿瘤如淋巴瘤、甲状腺癌等，也可引起颈部疼痛。
如果出现脖子两侧疼，建议及时就医，进行详细的检查，如甲状腺功能检查、颈部超声、血常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意休息，避免颈部过度劳累，保持良好的姿势，避免长时间低头或仰头。