病毒性结膜炎常用的眼药水有更昔洛韦眼用凝胶、阿昔洛韦滴眼液、利巴韦林滴眼液等，具体如下：
1.更昔洛韦眼用凝胶：属于抗病毒药物，对疱疹病毒有抑制作用，可用于治疗单纯疱疹病毒性角膜炎和预防其复发，也可用于治疗免疫功能正常者的急性疱疹性角膜结膜炎。
2.阿昔洛韦滴眼液：为抗病毒药，对单纯疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒等有抑制作用，主要用于单纯疱疹性角膜炎。
3.利巴韦林滴眼液：主要用于单纯疱疹病毒性角膜炎。
使用眼药水时，需要注意以下几点：
1.在医生的指导下使用，按照说明书的要求正确使用。
2.滴眼药水前，应先洗手，避免感染。
3.头部尽量向后仰，或仰卧在床上，用食指将下眼睑下拉，形成一个小囊，将眼药水滴入结膜囊中，每次1~2滴，不要过度挤压药瓶，以免引起刺激性咳嗽。
4.滴眼药水后，轻轻闭上眼睛，用手指轻轻按压内眼角1~2分钟，防止眼药水通过泪道流入鼻腔和口腔，减少副作用。
5.同时使用多种眼药水时，应先滴眼药水，间隔5~10分钟后再滴其他眼药水。
6.注意眼药水的保质期，避免使用过期的眼药水。
7.如果使用眼药水后出现眼部不适、红肿、疼痛等症状，应及时停止使用，并就医。
此外，病毒性结膜炎具有传染性，患者应注意个人卫生，避免与他人共用毛巾、脸盆等物品，避免前往公共场所，以免传染他人。同时，应注意休息，避免用眼过度，保持眼部清洁。如果症状严重或持续不缓解，应及时就医。