女性在排卵期间有同房行为后，小肚子隐隐作痛可能与以下因素有关：
1.卵子排出：在排卵期间，卵子会从卵巢中排出，这个过程可能会导致小肚子有轻微的疼痛，这是正常的生理现象。
2.精液刺激：同房时，精液进入阴道，可能会对子宫颈和子宫产生刺激，引起小肚子疼痛。
3.感染：如果同房时没有注意卫生，可能会导致细菌感染，引起盆腔炎、宫颈炎等妇科炎症，从而出现小肚子疼痛的症状。
4.其他因素：同房时动作过于剧烈、黄体破裂等也可能导致小肚子疼痛。
如果疼痛症状比较轻微，一般不需要特殊处理，注意休息，保持局部清洁卫生即可。如果疼痛症状比较严重，或者持续时间较长，建议及时就医，进行相关检查，如白带常规、B超等，以明确病因，并进行针对性治疗。
此外，需要注意的是，女性在排卵期间同房，如果没有生育需求，一定要做好避孕措施，以免意外怀孕。同时，要注意个人卫生，避免感染妇科炎症。如果出现白带异常、阴道瘙痒、下腹坠胀等不适症状，应及时就医，以免延误病情。