一般来说，在正确的剂量下，新生儿吃益生菌是相对安全的，可能不会产生明显的副作用。但由于每个新生儿的体质不同，益生菌的种类和品牌也有差异，所以也可能会出现一些不良反应，具体表现如下：
1.过敏反应：有些新生儿可能对益生菌中的某些成分过敏，从而出现过敏反应，如皮疹、腹泻、呕吐等。
2.消化不良：如果益生菌的剂量过大或服用方法不正确，可能会导致新生儿消化不良，出现腹胀、腹痛、便秘等症状。
3.肠道菌群失衡：益生菌虽然对肠道健康有益，但如果使用不当，可能会破坏肠道内的菌群平衡，导致其他问题的出现。
需要注意的是，以上副作用并不是一定会发生的，而且大多数情况下都是轻微的，可以通过调整剂量或更换益生菌品牌来缓解。如果新生儿在服用益生菌后出现严重的不适或异常症状，应及时就医，并告知医生详细的用药情况。同时，在给新生儿选择益生菌时，应选择适合新生儿年龄和体质的产品，并按照医生或营养师的建议使用。