如果已经来月经了，但是发现怀孕了，可能是以下原因导致的：
1.验孕棒或早孕试纸使用不当：验孕棒或早孕试纸可能会出现假阳性的结果，尤其是在使用不当的情况下。如果检测时间过早、尿液稀释或者验孕棒过期等，都可能导致结果不准确。
2.异位妊娠：受精卵在子宫以外的部位着床发育，称为异位妊娠。其中，以输卵管妊娠最为常见。异位妊娠时，孕妇也会出现停经，但可能会伴有阴道流血、腹痛等症状。如果不及时治疗，可能会导致大出血、休克等严重后果。
3.先兆流产：在怀孕早期，受精卵着床不稳固，可能会出现阴道流血、腹痛等先兆流产的症状。如果出血量较少，可能会被误认为是月经来潮。
4.其他疾病：某些疾病，如子宫肌瘤、子宫内膜息肉等，也可能导致阴道流血，容易被误认为是月经来潮。
如果已经来月经了，但是发现怀孕了，建议及时就医，进行详细的检查，以确定具体的原因。医生可能会建议进行B超检查、血HCG检测等，以明确孕囊的位置和发育情况。如果是异位妊娠，需要及时进行治疗；如果是先兆流产，需要根据具体情况进行保胎治疗。
此外，在确认怀孕后，需要注意以下事项：
1.补充叶酸：叶酸有助于预防胎儿神经管畸形，建议在怀孕前3个月开始补充，直至怀孕后3个月。
2.注意休息：避免过度劳累和剧烈运动，保证充足的睡眠。
3.合理饮食：保持均衡的饮食，多摄入富含蛋白质、维生素和矿物质的食物。
4.避免有害物质：避免接触有害物质，如辐射、化学物质等。
5.定期产检：按照医生的建议，定期进行产前检查，及时了解胎儿的发育情况。