牙齿根部痛通常是由以下原因引起的：
1.龋齿：细菌感染导致牙齿硬组织破坏，形成龋洞，当龋洞深及牙髓时，会引起牙痛。
2.牙髓炎：龋齿、楔状缺损等可导致牙髓感染，引起牙髓炎，主要症状为牙齿根部疼痛，疼痛性质为自发性、阵发性痛，夜间痛加剧，温度刺激疼痛加剧。
3.根尖周炎：牙髓炎未及时治疗，可发展为根尖周炎，导致根尖周组织发炎，引起牙齿根部疼痛，同时还可能伴有牙龈肿胀、咬合痛等症状。
4.牙周炎：菌斑、牙结石等刺激可引起牙龈发炎，若不及时治疗，炎症可进一步发展为牙周炎，导致牙槽骨吸收、牙齿松动，从而引起牙齿根部疼痛。
5.牙根纵裂：牙齿受到过大的外力或长期慢性损伤，可导致牙根纵裂，引起牙齿根部疼痛。
6.其他：如智齿冠周炎、牙本质过敏、三叉神经痛等也可引起牙齿根部疼痛。
治疗方法如下：
1.针对病因治疗：如龋齿需去除龋坏组织，进行充填治疗；牙髓炎、根尖周炎需进行根管治疗；牙周炎需进行牙周治疗等。
2.药物治疗：疼痛明显者，可口服布洛芬、对乙酰氨基酚等缓解疼痛。
3.其他治疗：如根管治疗后，可进行牙冠修复，以保护牙齿。
如果出现牙齿根部痛，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意口腔卫生，定期洗牙，预防口腔疾病的发生。