当婴儿肠道有炎症时，不建议自行用药，建议及时就医，在医生的指导下使用以下药物进行治疗：
1.抗生素：如果是细菌感染引起的肠道炎症，医生可能会开抗生素来消灭细菌。常用的抗生素包括头孢菌素、青霉素等。
2.抗病毒药物：如果是病毒感染引起的肠道炎症，医生可能会开抗病毒药物来抑制病毒的复制。常用的抗病毒药物包括利巴韦林、阿昔洛韦等。
3.益生菌：益生菌可以调节肠道菌群，改善肠道微生态，有助于缓解肠道炎症。常用的益生菌包括双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等。
4.蒙脱石散：蒙脱石散可以吸附肠道内的毒素和细菌，保护肠黏膜，减轻炎症。
5.口服补液盐：如果婴儿出现腹泻等症状，可能会导致脱水和电解质紊乱。医生可能会开口服补液盐来补充水分和电解质，防止脱水。
需要注意的是，以上药物的使用剂量和使用方法应根据婴儿的具体情况而定，家长应严格按照医生的建议使用药物。同时，在使用药物期间，应注意观察婴儿的症状变化，如果症状加重或出现其他异常情况，应及时就医。此外，还应注意婴儿的饮食卫生，避免食用不洁食物和生冷食物，保持婴儿的口腔清洁。